超聲波細胞破碎儀與變幅桿相連的換能器放入隔音箱頂部的插孔內，完后把電源線連接在主機后面的電源輸入接口；并連接好主機電源線。設定“超聲時間、間隙時間、工作次數”，一般超聲時間不宜開的過長，控制在1-5秒為宜，工作時選用間隙時間大于工作時間進行實驗。

    超聲波細胞破碎儀根據樣品量選用適配容器固定好后，調節隔音箱內的升降臺來確定高低位置，使變幅桿末端插入樣品液面1-1.5cm并使其在容器的中心位置，不得讓變幅桿與容器壁相接觸；變幅桿末端離容器一般應大于30mm，量小時，功率開小的情況下可大于10mm(視容器而定),開機后電源指示燈亮，再按一次保護復位按鈕及工作復位按鈕。超聲波細胞破碎儀避免長時間連續工作，不間斷長時間工作容易造成空載，縮短儀器的使用壽命。超聲波細胞破碎儀肯定會產熱，所以一定要有降溫裝置,超聲程序的設定。

    超聲波細胞破碎儀超聲程序設定就緒后，即可按開關開機。按下電源開關，此時電源指示燈亮，再按一次保護復位按扭及工作復位按扭，待設定的間隙時間過后，即進入震蕩狀態，將功率調節旋扭慢慢向順時針方向轉動，調至所需的功率位置上，以達到*理想的工作效果，待設定的總工作時間過后顯示屏顯示所設定的總時間。一切處于停振狀態，如需重復上述實驗，可再按工作復位按扭，如不重復，應關機，并切斷電源。如在工作時保護指示燈亮，說明超聲波細胞破碎儀的功率開的太大，而進入保護狀態，用旋扭1減低功率，按一次保護復位按鍵及工作復位按鍵，即開始工作。實驗完畢后，把探頭擦干凈，并填寫使用記錄。溫度保護設置點必須比室溫或樣品溫度高5℃以上。當發生超聲波細胞破碎儀超溫保護時，機子停止工作。

    超聲波細胞破碎儀嚴禁在變幅桿未插入液體內(空載)時開機，否則會損壞換能器或超聲波發生器，對各種細胞破碎量的多少，時間長短，功率大小，有待用戶根據各種不同細胞再摸索確定，選取*值。用一定時間后變幅桿末端會被空化腐蝕而發毛，可用油石或銼刀銼平，否則會影響工作效果。超聲波細胞破碎儀不需預熱，使用應有良好的接地。超聲波細胞破碎儀在超聲破碎時，由于超聲波在液體中起空化效應，使液體溫度會很快升高，用戶對各種細胞的溫度要多加注意。建議采用短時間(每次不超過5秒)的多次破碎，同時可外加冰浴冷卻。超聲波細胞破碎儀采用無工頻變壓器的開關電源，在打開發生器機殼后切勿亂摸，以防觸電。本儀器性能可靠，一般不易損壞，應安放在干燥，無潮濕、無陽光直射、無腐蝕性氣體的地方工作。